Program Unggulan
Pendidikan berbasis Spiritualitas
PPRU2 merupakan pondok pesantren yang didirikan oleh seorang mursyid tarekat al-Naqsyabandiyah Nidzomiyah/Ahmadiyah (Madura) oleh karenanya pendidikan yang unik di pesantren kami memadukan nilai akademik dan tarekat seperti pada kegiatan tawajjuhan bersama, dan sebagainya.
PPLBP
Program Praktik Lapangan Berbasis Penempatan disingkat PPLBP merupakan proyek unggulan PPRU2 yang menempatkan santri di daerah - daerah tertentu untuk mengembangkan skill kemasyarakatan dan keilmuan.
English Area
Merupakan program khas yang sudah ada sejak era pendiri (Kyai Qosim) yang mana merupakan sebuah area khusus yang tersistem dengan penggunaan Bahasa Inggris sebagai percakapan wajib harian.
Intensif Program Lomba Sains Olimpiade
Merupakan program rutin tahunan unit SMP, SMA, dan MA dalam menggembleng para santri untuk berpartisipasi aktif dalam OSN.
Program Baca Cepat Kitab Kuning
Merupakan program unggulan Madrasah Diniah PPRU2 dalam mencapai tujuan akademik dalam penguasaan membaca Kitab Klasik kosongan.
